Santri Madin Al-Islam Yogyakarta berhasil meraih juara dalam MQK (Musabaqah Qira'atul Kutub) Tingkat DIY di Kabupaten Gunungkidul yang dilaksanakan di Pondok Pesantren Darul Qur'an Wal Irsyad pada Rabu, 9 Oktober 2013.
Santri Al-Islam yang berhasil meraih prestasi juara adalah:
- Nur Hasanah : Juara 2 Bidang Tarikh Wustho Putri (Kitab Rokhitul Makhtum)
- Nuril Huda : Juara 3 Bidang Balaghah Wustho Putra (Kitab Jauharul Maknun)
- Novi A'yuni Masykuroh : Juara 3 Bidang Nahwu Ula Putri (Kitab Jurumiyah)
- Muhammad Atho'illah : Juara 3 Bidang Tarikh Ula Putra (Kitab Nurul Yaqin)
- Nicky Syahrul Adam : Juara harapan 1 Bidang Fiqih Ula Putra (Kitab Sullam Taufiq)
- Sayyidatur Rofi'ah : Juara harapan 1 Bidang Fiqih Ula Putri (Kitab Sullam Taufiq)
- Krisna Ulin Nuha : Juara harapan 1 Bidang Aklaq Ula Putra (Kitab Ta'limul Muta'allim)
- Iftitah Isykarima : Juara harapan 1 Bidang Akhlaq Ula Putri (Kitab Ta'lim Muta'allim)
- Miftakhu Zaqia :Juara harapan 1 Bidang Tarikh Putri (Kitab Nurul Yaqin)
- Thoriq Aqdam Avicena : Juara harapan 1 Bidang Nahwu Ula Putra (Kitab Jurumiyah)
Sebelumnya dalam seleksi tingkat Kota Yogyakarta yang berlangsung di Aula Kemenag Kota Yogyakarta pada bulan September 2013 para santri Al-Islam tersebut berhasil keluar sebagai juara 1 dan berhak mewakili Kota Yogyakarta pada MQK Tingkat DIY.
